又《成唯识论》卷3云：“若无能持染净种识，一切因果皆不得成。有执大乘遣相空理为究竟者，依似比量，拨无此识及一切法。彼特违害前所引经，智断证修、染净因果，皆执非实，成大邪见。外道毁谤染净因果，亦不谓全无，但执非实故。若一切法皆非实有，菩萨不应为舍生死，精勤修集菩提资粮。谁有智者为除幻敌，求石女儿用为军旅，故应信有能持种心。依之建立染净因果，彼心即是此第八识。”若无如来藏执持业种不失，是谁任持果报而丝毫不错乱？是谁能贯穿三世因果而不失？就是因为有如来藏心执持业种不失，于过去世五蕴坏灭时，如来藏与意根来至今世，而由如来藏阿赖耶识心体，以其独有的大种性自性来摄受四大物质，方能变现今世的色身等五蕴，而在今世受报。又于今世五蕴坏灭时，如来藏携带善恶业的所有种子，与意根去至未来世，而由如来藏心变现未来世的五蕴，而在未来世受苦乐报。因此，当然是如来藏心执持业种不失，才能贯穿三世果报而不失，菩萨就是因此实证上的了知，所以能精进修学佛菩提道，乃至成佛。
综合上面种种教证可知，如来藏真是胜义实有，非假名安立。若说如来藏是假名安立，无疑是毁 佛谤法，拨无因果，成大邪见！造地狱业，来世必定受诸苦受，长劫以后恐仍将难以重生为人，皆非有智之人。因此广劝众佛弟子们，莫再毁谤如来藏心为非胜义实有，乃至谤言大乘非 佛说；否则，妄说佛法，果报不轻。
二、如来藏与“我”之间的差异
有人认为认为一切皆空，一法不立方是究竟，认为如来藏法就是不离我见，是一种我的变相，乃至认为佛说如来藏法不过是方便说。那么我们就来看看，什么是“我”，如来藏与“我”之间有什么区别？
一般来说，提到“我”，都是我要这样，我要那样，在在处处都不离能取之心和所取之境而存在，能取之心也被称为见分，也即是七转识――眼耳鼻舌身意识和末那识，能取六尘诸法，与六尘相上见闻觉知。所取之境也被称为相分，也即是六尘之相――色声香味触等相而伴随生起其法相。表面看来如来藏能造就五蕴十八界一切法，似乎也是有能取之心，和所取之境，其实不然，这样的思维是不解世尊所说意，为不如理作意。下面我们不妨来看看佛经是怎么讲述的。
《大乘入楞伽经》云：“众生心所起，能取及所取，所见皆无相，愚夫妄分别；显示阿赖耶，殊胜之藏识，离于能所取，我说为真如。”众生的阿赖耶识心体所生起的能取的七转识，以及七转识心所取的六尘等法相，其实都是依阿赖耶识心体而起，非真实不坏，但是由于愚痴凡夫的虚妄分别而遍计所执，认为实有蕴我，处我，界我，执有实我实法，认为能取和所取都是真实不坏的法；虽然如此，在七转识的能取与所取的六尘相这二取相中，却能显现出阿赖耶识心体就是殊胜的如来藏识；这个如来藏识，其自身虽能生出能取所取，但其自性却是本来离于能取与所取，绝对不染着六尘万法，恒时清净，不生不灭，这个阿赖耶识心体，我说就是真如。
《大方广佛华严经》云：“善男子！譬如猛风吹大海水，波浪不停；由境界风飘静心海，起识波浪相续不断，因缘相作不相舍离，不一不异如水与波；由业生相深起系缚，不能了知色等自性五识身转；彼阿赖耶终不自言：我生七识。”阿赖耶识就好像大海一样，因风吹袭而波浪汹涌；由于外境界风所吹，阿赖耶识便依据五根而变现出内五尘相，七转识浪随之而起，不断攀缘五尘及其所生之法尘，相续生灭不断。虽如此，但阿赖耶识却好像大海自体，不会随风而去，如如不动。波浪是大海所生，但大海没有觉知性，不知道自己生起波浪，甚至不知道自己存在，不知道自己是大海，阿赖耶识同样如此，祂只是随缘而应，不断变现出有情众生的七转识和诸尘相，所变现的这些种种法相与阿赖耶识的关系，就好像大海和波浪的关系：不一不异。狭义来讲，虽生出这种种的法相，但自己却无法知道，也因无证自证分，甚至都不知道自己存在，所以“彼阿赖耶终不自言：我生七识。”
上面这些经文已经明确指出，阿赖耶识如来藏为无我性的，虽生万法而不自知，离于能取和所取，所以本性清净，具真如性，这和认为能取和所取为实有的“我见”有着本质的区别，那个生出“我见”心行的是染污末那和意识，此二识为阿赖耶识心体所生，为依祂起性，不得自在，即使消除此二识的我见我执，转染污成清净，他们也无法变成如来藏，因如来藏的“无我”性，非因修得，其体本来现成，本来如是，若想将第七末那识和第六意识转净后变为如来藏，那么此如来藏就是因修而得，不离生灭，且转净前，没有如来藏，此说完全违背世尊所言的“藏识恒不断”，完全违背世尊开示的“赖耶为依止，诸识从彼生”的垂训。再若末那识和意识转净变为如来藏，那么末那识和意识又到哪里去呢？世尊成佛尚八识共聚，非只有前五识和第八识，故如来藏是本来无我性的，此无我性非因修而得。
一切证悟之人，都能现前领受到自身如来藏的清净无我性，也能在一切有情身上，遍观其如来藏不染六尘的无我自在性，故而诸师有云：“常有无位真人由面门出入”，既言“无位”，就表示本无住，本无我，本无形，本不分别；既言“真人”，就表示本无生，本无灭，本无染，本具圆成实性，既言“常由面门出入”就表示其非无用，非无能，而具大妙用，所以佛经中也常称之为“无我如来藏”。
《大乘入楞伽經》：“显示阿赖耶，殊胜之藏识，离于能所取，我说为真如。”虽然如此明言，但仍有很多人分辩不清“我”与“阿赖耶识心体如来藏”之间的关系，仍然认为阿赖耶识心体如来藏就是外道所说的常我，就是我见的另一种表现，就是于本无所有中自己虚妄计度的安立。譬如刚刚去世的印顺法师在其所著的《印度佛教思想史》中这样写到：“佛法说无我，而现在极力说如来藏我，到底我是什么？《大般涅槃经》说：‘何者是我？若法是实、是真、是常、是主、是依、性不变易者，是名为我。’这与奥义书所说我，是常、是乐、是知，似乎相差不远。”印顺法师在台湾佛教界被尊为导师，其影响不可为不巨，其在书中多次指出，世尊三转法轮所讲述的如来藏和外道梵我思想相差不远。以印顺法师为代表的那些所谓大师们，否定如来藏思想，认为如来藏思想不过是外道梵我思想的演化，认为如来藏思想不过是世尊方便的安立。对此世尊在《楞严经》中云：“陀那甚深细，种子如瀑流；我常不开演，恐彼执为我。”也就是说：阿赖耶识陀的心行极为微密深细，其所含藏的种子就好像瀑布流淌一般不断的流注；我对凡夫及二乘圣人常常都宣说这个关于阿赖耶识的妙法，因为我恐怕那些人将产生误会而将阿赖耶识执着为常见外道所说的常我、神我。世尊如此明言，但还是有愚痴凡夫，一叶遮目，自蒙其眼，不能安忍如来藏，不能理清“我”与“无我如来藏”之间的关系，如此之人实堪可怜。
摘录《央掘魔罗经》卷二中世尊的殷殷告诫与诸学人共勉，愿持否定如来藏观点者得以仔细思量，早日醒悟忏悔，如此今生方有机会趋入正法，得证无生。
“闻如来藏不生信乐。如鸱鸺鸟昼盲夜见好暗恶明。彼诸众生亦复如是。好邪恶正不乐见佛及如来藏。去来现在不生信乐。如彼鸱鸺好暗恶明。如人长夜修习邪见。染诸外道不正之说以宿习故今犹不舍。彼诸众生亦复如是。久习无我隐覆之教。如彼凡愚染诸邪说。去来现在不解密教。闻如来藏不生信乐非余众生。若人过去曾值诸佛。供养奉事闻如来藏。于弹指顷蹔得听受。”
三、如来藏在吾人身中
如来藏既是胜义实有，非假名安立，那?如来藏究竟在哪里？就有必要探究一下，这可从以下几个方面来说明：
一者，如来藏在吾人身中：《深密解脱经》卷一：“广慧！彼识名阿陀那识，何以故？以彼阿陀那识取此身、相应身故。广慧！亦名阿梨耶识，何以故？以彼身中住着故，一体相应故。” 佛说：“广慧啊！这个第八识又名阿陀那识，为什么叫做阿陀那识呢？因为这个阿陀那识，祂在有情的色身里，一直执持着这个色身，每一秒每一剎那都在配合色身而运作无间。这个执持众生色身的阿陀那识，也称为阿赖耶识。为什么称为阿赖耶识呢？因为这个阿赖耶识，一直住在自己所造的色身里，与色身犹如一体的不断相应而配合运作。”
世尊在经中已明白指出这个圆成实性的阿陀那识（阿陀那识即是阿赖耶识、如来藏之异名），就住在众生的色身中，与众生的色身和合为一，遍身而住。当众生造作一切身口意行，引发不同之善恶业种，执藏于如来藏心中，因为有此执藏分段生死业种的执藏性，所以才名如来藏心为阿赖耶识，成为引发后有之因。这些善恶业种，都由阿赖耶识携至未来世，于因缘际会时，再由阿赖耶识流注相应的业种，成就自己所造的五阴身，或在人间、或在天上受诸苦乐，或处地狱受种种苦报，如此因果循环丝毫不乱。若非众生各有阿赖耶识执持色身，以记录各自一切身口意行，无疑就会因果错乱：行善众生不得善果，五逆十恶、毁 佛谤法的众生却升天上。因无有能记载其善恶业行的阿赖耶识随身，祖师所言“万般带不去，唯有业随身”的名言，也将顿成空谈。若认为阿赖耶识住于虚空，那么这个住于虚空的阿赖耶识与色身就是完全分离的两个个体，不能同时同处配合运作，祂又是如何记载有情众生的一切身口意行业种？又如何了知众生的起心动念，乃至如何配合众生而正常运作？因此可知，阿赖耶识一定就在吾人色身中。
二者，吾人身中如来藏本体，与 世尊的如来藏（改名无垢识）一样清凈。《大方等如来藏经》云：“善男子！我见众生种种烦恼，长夜流转生死无量。如来妙藏在其身内，俨然清净与我无异……我观诸众生，婴苦亦如是，身怀如来藏，而不自觉知；是故告菩萨，慎勿自轻鄙，汝身如来藏，常有济世明；若勤修精进，不久坐道场，成最正觉道，度脱无量众。” 佛说：“善男子！我看见众生被种种无明烦恼所系缚，于无量生死中头出头没，无有尽期。这些众生虽然被无明烦恼所覆而长久的住在无明暗夜中，但他们身内的如来藏，还是和我一样，本来、自性、清净、涅盘……我看见众生被种种烦恼痛苦逼迫，身中怀着和我一样清净的如来藏心，而都不能自己发现祂的存在。所以我告诉各位菩萨：不要看轻自己、鄙视自己，在你们每一个人的身中，都有与我一样具大功用的如来藏，常常都救济世间众生之光明显发出来。如果你们能够信受我所说的话，勇猛精进的修证，不久就可以触证如来藏心，而得到般若中观智（亦名总相智、根本无分别智），那么就可以依如来藏无生的智能，进修相见道所应得的别相智而达初地通达位，进修地上菩萨所应得的道种智，乃至终于证得一切种智而究竟成佛，就可以度脱无量无边的苦难轮回的众生。”
由 佛的开示，已经明白告诉我们，如来藏本体就在吾人身中，与 世尊一样清凈，若能证得此心如来藏，才算是真正开始内门修学菩萨道的不退菩萨，真正的走上成佛之道。虽然我们如来藏本体与 世尊无垢识一样的清净，可是我们如来藏所含藏的七转识种子却有染污，未如 世尊一样究竟清净，因此悟后须再经过将近二大无量数劫，断除烦恼障种子现行而断除分段生死，其如来藏（阿赖耶识）舍阿赖耶识名，改名为异熟识；再经历一大无量数劫，断除烦恼障习气种子随眠、所知障无明随眠，究竟清净时改异熟识名为无垢识而究竟成佛。一切有情众生，无论是凡夫地，菩萨地乃至佛地，其如来藏都在其各自的报身内，俨然清净无染，同 佛无异。
三者，因有如来藏住于身中，才能执持业种，才有吾人色身及身量大小不同：契经云：“或名阿陀那，执持种子及诸色根而不坏故。”经中已明说，中阴身投胎时，能见有缘父母和合，无正知见及生颠倒见，而不正知入于胎（受精卵）中。又，若无如来藏执持受精卵，则受精卵必定烂坏。又，由于如来藏阿赖耶识心体恒具有大种性自性，不断地从母体里摄取四大，而渐渐成就自己的色身，乃至五根具足。因此众生的色身，乃至五根具足，都是以如来藏?因，以父精母血及四大为缘，而由如来藏所变现制造的。
在受精卵位时，尚不具五根，六识就不现前，因此当时的“名、色”当中，仅有受精卵、意根及如来藏。直到受精卵发育到四、五个月以后，五根方始具足基本的功能（可从医学报导得知），连同最先的意根在内，六根就具足了。因为六根具足的关系，就能接触外五尘；因能够接触外五尘，如来藏就能变生内六尘，就能生眼等六识现行，具足十八界，因此才能在人间运作及受用。
